Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
USP17L2Q6R6M4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L2Q6R6M4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms