Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM88Q6PEY1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM88Q6PEY1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms