Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFSP1Q6NVU6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UFSP1Q6NVU6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms