Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NANOGP8Q6NSW7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NANOGP8Q6NSW7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NANOGP8Q6NSW7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms