Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SUMO4Q6EEV6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SUMO4Q6EEV6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms