Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT39Q6A163 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT39Q6A163 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms