Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
INTS3Q68E01 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
INTS3Q68E01 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms