Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF123Q5XPI4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF123Q5XPI4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms