Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USPL1Q5W0Q7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USPL1Q5W0Q7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms