Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND4CQ5VZ89 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DENND4CQ5VZ89 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DENND4CQ5VZ89 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms