Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRCH2Q5VUJ6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRCH2Q5VUJ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRCH2Q5VUJ6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms