Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RNF20Q5VTR2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RNF20Q5VTR2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RNF20Q5VTR2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms