Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WDR78Q5VTH9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
WDR78Q5VTH9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WDR78Q5VTH9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms