Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
STRIP1Q5VSL9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
STRIP1Q5VSL9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STRIP1Q5VSL9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms