Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM78Q5T7P6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM78Q5T7P6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms