Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T1

TMEM170B, Transmembrane protein 170B, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM170BQ5T4T1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM170BQ5T4T1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM170BQ5T4T1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM170BQ5T4T1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM170BQ5T4T1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM170BQ5T4T1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM170BQ5T4T1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM170BQ5T4T1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM170BQ5T4T1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms