Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NUP188Q5SRE5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NUP188Q5SRE5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms