Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PITRM1Q5JRX3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PITRM1Q5JRX3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PITRM1Q5JRX3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms