Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAVIN4Q5BKX8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAVIN4Q5BKX8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms