Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHLDA2Q53GA4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms