Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF260Q3ZCT1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF260Q3ZCT1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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