Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRFIP1Q32MZ4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRFIP1Q32MZ4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms