Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHL38Q2WGJ6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL38Q2WGJ6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms