Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MSMPQ1L6U9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MSMPQ1L6U9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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