Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IMPG1Q17R60 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IMPG1Q17R60 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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