Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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NRF1Q16656 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
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NRF1Q16656 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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NRF1Q16656 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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NRF1Q16656 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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NRF1Q16656 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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NRF1Q16656 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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NRF1Q16656 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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NRF1Q16656 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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NRF1Q16656 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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NRF1Q16656 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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NRF1Q16656 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRF1Q16656 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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