Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

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Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC2Q16515 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC2Q16515 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ASIC2Q16515 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC2Q16515 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC2Q16515 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC2Q16515 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC2Q16515 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC2Q16515 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC2Q16515 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC2Q16515 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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