Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKN1Q16512 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKN1Q16512 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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