Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP6AP1Q15904 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP6AP1Q15904 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP6AP1Q15904 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
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