Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NCOA1Q15788 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
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NCOA1Q15788 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
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NCOA1Q15788 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
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NCOA1Q15788 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
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NCOA1Q15788 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
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NCOA1Q15788 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
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NCOA1Q15788 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NCOA1Q15788 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA1Q15788 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
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