Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIP4Q15650 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIP4Q15650 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms