Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TAF13Q15543 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TAF13Q15543 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms