Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRD3Q15059 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRD3Q15059 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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