Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.382e-8■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 JPT2-210ENST00000566925 570 ntTSL 48.35□□□□□ -1.072e-8■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 NDUFS8-202ENST00000432321 936 ntTSL 215.48■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 NDUFS8-215ENST00000532399 3072 ntTSL 214.28□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 NDUFS8-211ENST00000529645 606 ntTSL 311.3□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 FBL-210ENST00000599159 1400 ntTSL 1 (best)21.19■□□□□ 0.983e-10■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 FBL-211ENST00000601274 877 ntTSL 520.29■□□□□ 0.843e-10■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 FBL-203ENST00000594309 603 ntTSL 220.29■□□□□ 0.843e-10■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.753e-10■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 FBL-209ENST00000599134 500 ntTSL 519.15■□□□□ 0.663e-10■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 FBL-208ENST00000598417 581 ntTSL 517.47■□□□□ 0.393e-10■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 FBL-207ENST00000597634 726 ntTSL 514.17□□□□□ -0.143e-10■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 FBL-204ENST00000594443 805 ntTSL 311.58□□□□□ -0.563e-10■■■■■ 46.3
EFTUD2Q15029 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.787e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.687e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.637e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.597e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.597e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.537e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.537e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-211ENST00000567444 635 ntTSL 220.73■□□□□ 0.917e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.827e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.757e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.647e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-207ENST00000563012 646 ntTSL 318.47■□□□□ 0.557e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.427e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-209ENST00000565777 1313 ntTSL 216.4■□□□□ 0.227e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-204ENST00000561855 672 ntTSL 514.74□□□□□ -0.057e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-213ENST00000568411 599 ntTSL 313.96□□□□□ -0.177e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MAZ-206ENST00000562557 475 ntTSL 312.04□□□□□ -0.487e-12■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 P3H1-212ENST00000481465 728 ntTSL 211.05□□□□□ -0.645e-8■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MFSD12-203ENST00000398558 1014 ntTSL 218.81■□□□□ 0.62e-9■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 CXXC1-216ENST00000591474 845 ntTSL 320.86■□□□□ 0.933e-8■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 CRIP2-209ENST00000551738 595 ntTSL 324.63■■□□□ 1.533e-7■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 CRIP2-205ENST00000548309 1893 ntTSL 1 (best)19.4■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 CRIP2-207ENST00000548989 1976 ntTSL 219.35■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 NCLN-202ENST00000586904 836 ntTSL 516.42■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 MCM3-203ENST00000421471 1030 ntTSL 59.35□□□□□ -0.913e-7■■■■■ 46.2
EFTUD2Q15029 IL17RC-216ENST00000461995 862 ntTSL 317.53■□□□□ 0.48e-11■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 PLXND1-207ENST00000504979 591 ntTSL 317.04■□□□□ 0.328e-11■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 IL17RC-217ENST00000464406 807 ntTSL 215.59■□□□□ 0.098e-11■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 ITGB5-210ENST00000496703 789 ntTSL 215.43■□□□□ 0.068e-11■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 LMBR1L-220ENST00000551272 472 ntTSL 213.73□□□□□ -0.218e-11■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.338e-11■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.388e-11■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 ITGB5-206ENST00000476988 492 ntTSL 49.56□□□□□ -0.888e-11■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 BECN1-208ENST00000588276 769 ntTSL 36.65□□□□□ -1.348e-11■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 BECN1-209ENST00000589492 597 ntTSL 26.49□□□□□ -1.378e-11■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 GTF3C6-202ENST00000480191 800 ntTSL 35.94□□□□□ -1.468e-11■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 BECN1-215ENST00000590764 854 ntTSL 25.68□□□□□ -1.58e-11■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.972e-13■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.792e-13■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.272e-13■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.272e-13■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.112e-13■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.12e-13■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-13■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-13■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 ALDOA-211ENST00000564521 2534 ntTSL 513.95□□□□□ -0.182e-13■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.192e-13■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.22e-13■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-13■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 STXBP2-212ENST00000597467 821 ntTSL 321.33■■□□□ 1.019e-8■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 STXBP2-218ENST00000599905 589 ntTSL 419.16■□□□□ 0.669e-8■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 STXBP2-207ENST00000595181 632 ntTSL 29.53□□□□□ -0.889e-8■■■■■ 46.1
EFTUD2Q15029 VASP-211ENST00000592139 424 ntTSL 321.2■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 46
EFTUD2Q15029 VASP-210ENST00000590603 388 ntTSL 219.33■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 46
EFTUD2Q15029 POLD2-215ENST00000481763 810 ntTSL 320.27■□□□□ 0.846e-9■■■■■ 45.9
EFTUD2Q15029 POLD2-217ENST00000496539 571 ntTSL 214.56□□□□□ -0.086e-9■■■■■ 45.9
EFTUD2Q15029 POLD2-203ENST00000418438 556 ntTSL 414.21□□□□□ -0.136e-9■■■■■ 45.9
EFTUD2Q15029 NAPRT-212ENST00000525583 1066 ntTSL 521.16■□□□□ 0.982e-7■■■■■ 45.9
EFTUD2Q15029 NAPRT-209ENST00000488096 1032 ntTSL 518.14■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 45.9
EFTUD2Q15029 NAPRT-214ENST00000532645 866 ntTSL 516.73■□□□□ 0.273e-7■■■■■ 45.9
EFTUD2Q15029 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.051e-12■■■■■ 45.9
EFTUD2Q15029 ASF1A-202ENST00000511766 573 ntTSL 213.33□□□□□ -0.281e-12■■■■■ 45.9
EFTUD2Q15029 MYBBP1A-209ENST00000573723 613 ntTSL 511.49□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 PGS1-214ENST00000591996 3062 ntTSL 1 (best)13.69□□□□□ -0.225e-10■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 SMG9-207ENST00000598860 574 ntTSL 210.15□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 C8orf44-203ENST00000519561 1835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.531e-11■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 C8orf44-SGK3-201ENST00000519289 2949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.861e-11■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 C8orf44-204ENST00000521113 575 ntTSL 28.79□□□□□ -11e-11■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.351e-11■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 C8orf44-SGK3-202ENST00000520044 628 ntTSL 35.68□□□□□ -1.51e-11■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 SHMT2-220ENST00000555634 964 ntTSL 511.12□□□□□ -0.634e-8■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 SFXN2-208ENST00000602660 667 ntTSL 215.16■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 DDX5-222ENST00000583201 556 ntTSL 22.88□□□□□ -1.959e-14■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 DDX5-217ENST00000581551 573 ntTSL 22.68□□□□□ -1.989e-14■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 FLNC-203ENST00000388853 570 ntTSL 214.94□□□□□ -0.025e-9■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 AC138393.1-202ENST00000618315 487 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.173e-13■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 AC138393.1-201ENST00000622033 624 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.463e-13■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 UNC45A-215ENST00000557212 1528 ntTSL 217.52■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 UNC45A-210ENST00000553671 855 ntTSL 315.35■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 45.8
EFTUD2Q15029 GPR162-207ENST00000545321 683 ntTSL 224.85■■□□□ 1.571e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 MAP4K2-210ENST00000470088 1805 ntTSL 523.88■■□□□ 1.411e-8■■■■■ 45.7
EFTUD2Q15029 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.341e-8■■■■■ 45.7
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