Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAPTM4AQ15012 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LAPTM4AQ15012 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms