Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLCA4Q14CN2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CLCA4Q14CN2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
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