Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RRP1BQ14684 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRP1BQ14684 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
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