Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC3Q14574 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DSC3Q14574 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC3Q14574 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC3Q14574 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC3Q14574 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC3Q14574 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DSC3Q14574 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC3Q14574 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC3Q14574 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC3Q14574 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC3Q14574 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC3Q14574 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC3Q14574 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DSC3Q14574 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DSC3Q14574 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DSC3Q14574 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms