Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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GBX1Q14549 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GBX1Q14549 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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GBX1Q14549 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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GBX1Q14549 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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GBX1Q14549 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX1Q14549 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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