Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCARF1Q14162 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCARF1Q14162 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
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