Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB33AQ14088 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB33AQ14088 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB33AQ14088 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms