Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKAP5Q14008 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP5Q14008 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
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