Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TUBA3CQ13748 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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