Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAPSNQ13702 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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