Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf61Q13536 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms