Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRQ13535 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRQ13535 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRQ13535 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRQ13535 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRQ13535 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRQ13535 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRQ13535 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRQ13535 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRQ13535 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRQ13535 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRQ13535 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRQ13535 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRQ13535 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATRQ13535 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATRQ13535 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATRQ13535 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRQ13535 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRQ13535 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRQ13535 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRQ13535 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRQ13535 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRQ13535 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRQ13535 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRQ13535 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRQ13535 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRQ13535 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATRQ13535 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ATRQ13535 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRQ13535 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRQ13535 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRQ13535 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRQ13535 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRQ13535 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRQ13535 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRQ13535 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRQ13535 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRQ13535 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRQ13535 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRQ13535 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATRQ13535 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATRQ13535 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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