Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGDRQ13258 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTGDRQ13258 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGDRQ13258 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGDRQ13258 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGDRQ13258 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGDRQ13258 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGDRQ13258 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGDRQ13258 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms