Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRDNQ13061 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRDNQ13061 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
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