Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PRDM2Q13029 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRDM2Q13029 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
PRDM2Q13029 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PRDM2Q13029 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
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