Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ECH1Q13011 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ECH1Q13011 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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